Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HRCT1Q6UXD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms