Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms