Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms