Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L1Q676U5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms