Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USPL1Q5W0Q7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USPL1Q5W0Q7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms