Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms