Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTXN3Q4LDR2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTXN3Q4LDR2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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