Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCGF3Q3KNV8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms