Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms