Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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