Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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