Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GABRA6Q16445 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GABRA6Q16445 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GABRA6Q16445 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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