Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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E2F4Q16254 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F4Q16254 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms