Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PPP4C-204ENST00000562664 941 ntTSL 326.38■■□□□ 1.813e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 220.45■□□□□ 0.866e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.766e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 219.79■□□□□ 0.769e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 RPL18-207ENST00000549533 666 ntTSL 219.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 317.63■□□□□ 0.416e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 215.77■□□□□ 0.126e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 214.6□□□□□ -0.079e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 214.52□□□□□ -0.099e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 210.62□□□□□ -0.719e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.39□□□□□ -0.919e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 221.19■□□□□ 0.983e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-202ENST00000536072 2375 ntTSL 217.4■□□□□ 0.383e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 320.64■□□□□ 0.894e-13■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 PDCD6IP-209ENST00000473593 540 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.521e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.81e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 523.58■■□□□ 1.371e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.941e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 519.04■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 VARS-228ENST00000495010 1007 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-202ENST00000587913 286 ntTSL 313.28□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.42□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.511e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 ARID1A-215ENST00000636958 1388 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-13■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-9■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.262e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.262e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-215ENST00000523922 493 ntTSL 325.12■■□□□ 1.612e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-210ENST00000520454 488 ntTSL 320.49■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-208ENST00000519916 597 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-214ENST00000523146 476 ntTSL 53.65□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.042e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-209ENST00000437575 473 ntTSL 328.15■■■□□ 2.15e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-211ENST00000443615 557 ntTSL 323.28■■□□□ 1.325e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 522.73■■□□□ 1.235e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 U2AF2-204ENST00000587275 554 ntTSL 422.35■■□□□ 1.175e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.15e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-206ENST00000419490 538 ntTSL 421.1■□□□□ 0.975e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-208ENST00000424732 970 ntTSL 320.23■□□□□ 0.835e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 319.97■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-204ENST00000414993 727 ntTSL 417.58■□□□□ 0.45e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 516.51■□□□□ 0.234e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 04e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 CREB3L1-205ENST00000616094 1817 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.554e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 511.34□□□□□ -0.594e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 510.83□□□□□ -0.684e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.215e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMB2-209ENST00000480640 563 ntTSL 316.56■□□□□ 0.245e-16■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMB2-218ENST00000538659 576 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-16■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 319.3■□□□□ 0.689e-9■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.921e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.494e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.39□□□□□ -0.594e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.95□□□□□ -1.464e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 327.23■■□□□ 1.953e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.763e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-7■□□□□ 8.4
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 302.1 ms