Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PPP4C-204ENST00000562664 941 ntTSL 326.38■■□□□ 1.813e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 220.45■□□□□ 0.866e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.766e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 219.79■□□□□ 0.769e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 RPL18-207ENST00000549533 666 ntTSL 219.16■□□□□ 0.666e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 317.63■□□□□ 0.416e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 215.77■□□□□ 0.126e-12■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 214.6□□□□□ -0.079e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 214.52□□□□□ -0.099e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 210.62□□□□□ -0.719e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.39□□□□□ -0.919e-15■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 221.19■□□□□ 0.983e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-202ENST00000536072 2375 ntTSL 217.4■□□□□ 0.383e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 320.64■□□□□ 0.894e-13■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 PDCD6IP-209ENST00000473593 540 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.521e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.81e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 523.58■■□□□ 1.371e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.941e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 519.04■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 VARS-228ENST00000495010 1007 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 UBALD2-202ENST00000587913 286 ntTSL 313.28□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.42□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.511e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 ARID1A-215ENST00000636958 1388 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-13■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■□□□□ 8.6
PCBP1Q15365 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-9■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.262e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.262e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-215ENST00000523922 493 ntTSL 325.12■■□□□ 1.612e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-210ENST00000520454 488 ntTSL 320.49■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-208ENST00000519916 597 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 ZNF706-214ENST00000523146 476 ntTSL 53.65□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.042e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-27■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-209ENST00000437575 473 ntTSL 328.15■■■□□ 2.15e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-211ENST00000443615 557 ntTSL 323.28■■□□□ 1.325e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 522.73■■□□□ 1.235e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 U2AF2-204ENST00000587275 554 ntTSL 422.35■■□□□ 1.175e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.15e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-206ENST00000419490 538 ntTSL 421.1■□□□□ 0.975e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-208ENST00000424732 970 ntTSL 320.23■□□□□ 0.835e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 319.97■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-204ENST00000414993 727 ntTSL 417.58■□□□□ 0.45e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 516.51■□□□□ 0.234e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 04e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 CREB3L1-205ENST00000616094 1817 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.554e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 511.34□□□□□ -0.594e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 510.83□□□□□ -0.684e-13■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.215e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMB2-209ENST00000480640 563 ntTSL 316.56■□□□□ 0.245e-16■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMB2-218ENST00000538659 576 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-16■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 319.3■□□□□ 0.689e-9■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.921e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-10■□□□□ 8.5
PCBP1Q15365 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.494e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.39□□□□□ -0.594e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.95□□□□□ -1.464e-26■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 327.23■■□□□ 1.953e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.763e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-7■□□□□ 8.4
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