Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms