Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE3AQ14432 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE3AQ14432 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms