Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms