Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms