Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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