Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms