Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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