Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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