Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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