Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNB2Q08289 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms