Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms