Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms