Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC6Q03468 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms