Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms