Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC008770.1-204ENST00000489336 622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms