Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms