Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms