Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms