Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms