Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms