Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms