Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms