Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD11P31277 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PPP2R3C-213ENST00000555644 1347 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 AC009495.1-201ENST00000428888 372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD11P31277 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms