Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms