Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms