Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCHP24723 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCHP24723 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms