Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms