Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHCEP18577 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms