Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms