Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODC1P11926 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODC1P11926 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODC1P11926 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODC1P11926 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ODC1P11926 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms