Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF1P10914 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF1P10914 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF1P10914 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF1P10914 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms