Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCF2P10911 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCF2P10911 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCF2P10911 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms