Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms