Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NGFRP08138 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms