Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOP08100 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOP08100 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOP08100 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOP08100 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOP08100 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms