Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLK3P07288 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms